Convert adjacency matrix to an adjacency list

adjacencyMatrix2List(mat, keep.zero = FALSE)

Arguments

mat	A numeric matrix.
keep.zero	Whether to keep the interactions with value zero.

Examples

set.seed(999)
mat = matrix(sample(18, 18), 3, 6)
rownames(mat) = paste0("S", 1:3)
colnames(mat) = paste0("E", 1:6)
adjacencyMatrix2List(mat)
#>    from to value
#> 1    S1 E1     4
#> 2    S2 E1     7
#> 3    S3 E1     9
#> 4    S1 E2    14
#> 5    S2 E2     1
#> 6    S3 E2    10
#> 7    S1 E3    13
#> 8    S2 E3     6
#> 9    S3 E3     3
#> 10   S1 E4    17
#> 11   S2 E4     8
#> 12   S3 E4    16
#> 13   S1 E5     5
#> 14   S2 E5    12
#> 15   S3 E5    11
#> 16   S1 E6     2
#> 17   S2 E6    15
#> 18   S3 E6    18