get_consensus-ConsensusPartition-method.RdGet consensus matrix
# S4 method for ConsensusPartition
get_consensus(object, k)A ConsensusPartition-class object.
Number of subgroups.
For row i and column j in the consensus matrix, the value of corresponding x_ij is the probability of sample i and sample j being in the same group from all partitions.
A consensus matrix corresponding to the current k.
data(golub_cola)
obj = golub_cola["ATC", "skmeans"]
get_consensus(obj, k = 2)
#> sample_39 sample_40 sample_42 sample_47 sample_48 sample_49 sample_41
#> sample_39 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_40 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_42 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_47 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_48 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_49 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_41 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_43 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_44 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_45 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_46 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_70 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_71 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_72 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_68 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_69 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_67 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_55 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_56 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_59 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_52 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_53 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_51 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_50 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_54 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_57 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_58 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_60 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_61 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_65 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_66 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_63 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_64 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_62 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_1 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_2 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_3 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_4 0.94 0.94 0.06 0.06 0.06 0.94 0.06
#> sample_5 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_6 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_7 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_8 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_9 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_10 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_11 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_12 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_13 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_14 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_15 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_16 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_17 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_18 0.10 0.10 0.90 0.90 0.90 0.10 0.90
#> sample_19 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_20 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_21 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_22 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_23 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_24 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_25 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_26 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_27 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_34 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_35 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_36 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_37 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_38 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_28 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_29 0.00 0.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_30 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_31 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_32 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_33 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_43 sample_44 sample_45 sample_46 sample_70 sample_71 sample_72
#> sample_39 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_40 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_42 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_47 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_48 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_49 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_41 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_43 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_44 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_45 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_46 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_70 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_71 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_72 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_68 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_69 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_67 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_56 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_59 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_52 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_51 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_50 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_54 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_60 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_65 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_66 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_64 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_2 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_3 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_4 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06
#> sample_5 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_7 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_8 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_9 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_10 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_11 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_12 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_13 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_14 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_15 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_16 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_17 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_18 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90
#> sample_19 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_20 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_21 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_23 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_24 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_26 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_27 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_34 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_36 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_37 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_38 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_28 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_29 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_32 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_33 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_68 sample_69 sample_67 sample_55 sample_56 sample_59 sample_52
#> sample_39 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_40 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_42 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_47 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_48 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_49 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_41 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_43 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_44 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_45 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_46 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_70 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_71 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_72 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_68 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_69 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_67 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_55 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_56 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_59 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_52 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_53 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_51 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_50 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_54 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_57 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_58 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_60 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_61 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_65 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_66 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_63 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_64 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_62 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_1 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_2 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_3 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_4 0.06 0.06 0.06 0.94 0.94 0.06 0.94
#> sample_5 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_6 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_7 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_8 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_9 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_10 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_11 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_12 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_13 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_14 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_15 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_16 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_17 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_18 0.90 0.90 0.90 0.10 0.10 0.90 0.10
#> sample_19 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_20 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_21 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_22 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_23 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_24 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_25 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_26 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_27 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_34 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_35 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_36 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_37 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_38 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_28 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_29 1.00 1.00 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00
#> sample_30 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_31 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_32 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_33 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 0.00 1.00
#> sample_53 sample_51 sample_50 sample_54 sample_57 sample_58 sample_60
#> sample_39 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_40 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_42 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_47 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_48 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_49 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_41 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_43 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_44 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_45 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_46 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_70 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_71 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_72 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_68 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_69 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_67 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_55 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_56 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_59 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_52 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_53 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_51 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_50 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_54 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_57 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_58 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_60 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_61 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_65 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_66 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_63 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_64 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_62 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_1 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_2 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_3 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_4 0.94 0.94 0.94 0.06 0.94 0.94 0.06
#> sample_5 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_6 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_7 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_8 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_9 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_10 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_11 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_12 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_13 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_14 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_15 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_16 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_17 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_18 0.10 0.10 0.10 0.90 0.10 0.10 0.90
#> sample_19 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_20 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_21 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_22 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_23 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_24 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_25 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_26 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_27 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_34 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_35 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_36 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_37 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_38 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_28 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_29 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_30 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_31 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_32 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_33 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_61 sample_65 sample_66 sample_63 sample_64 sample_62 sample_1
#> sample_39 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_40 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_42 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_47 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_48 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_49 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_41 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_43 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_44 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_45 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_46 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_70 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_71 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_72 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_68 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_69 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_67 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_55 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_56 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_59 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_52 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_53 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_51 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_50 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_54 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_57 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_58 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_60 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_61 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_65 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_66 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_63 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_64 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_62 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_1 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_2 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_3 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_4 0.94 0.94 0.06 0.94 0.94 0.94 0.94
#> sample_5 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_6 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_7 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_8 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_9 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_10 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_11 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_12 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_13 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_14 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_15 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_16 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_17 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_18 0.10 0.10 0.90 0.10 0.10 0.10 0.10
#> sample_19 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_20 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_21 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_22 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_23 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_24 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_25 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_26 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_27 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_34 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_35 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_36 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_37 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_38 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_28 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_29 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_30 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_31 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_32 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_33 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_2 sample_3 sample_4 sample_5 sample_6 sample_7 sample_8
#> sample_39 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_40 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_42 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_47 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_48 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_49 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_41 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_43 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_44 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_45 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_46 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_70 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_71 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_72 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_68 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_69 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_67 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_55 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_56 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_59 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_52 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_53 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_51 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_50 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_54 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_57 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_58 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_60 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_61 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_65 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_66 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_63 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_64 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_62 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_1 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_2 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_3 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_4 0.06 0.94 1.00 0.06 0.94 0.94 0.94
#> sample_5 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_6 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_7 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_8 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_9 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_10 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_11 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_12 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_13 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_14 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_15 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_16 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_17 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_18 0.90 0.10 0.16 0.90 0.10 0.10 0.10
#> sample_19 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_20 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_21 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_22 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_23 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_24 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_25 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_26 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_27 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_34 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_35 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_36 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_37 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_38 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_28 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_29 1.00 0.00 0.06 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_30 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_31 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_32 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_33 0.00 1.00 0.94 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_9 sample_10 sample_11 sample_12 sample_13 sample_14 sample_15
#> sample_39 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_40 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_42 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_47 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_48 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_49 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_41 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_43 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_44 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_45 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_46 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_70 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_71 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_72 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_68 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_69 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_67 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_55 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_56 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_59 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_52 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_53 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_51 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_50 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_54 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_57 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_58 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_60 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_61 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_65 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_66 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_63 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_64 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_62 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_1 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_2 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_3 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_4 0.06 0.06 0.06 0.94 0.06 0.06 0.06
#> sample_5 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_6 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_7 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_8 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_9 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_10 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_11 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_12 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_13 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_14 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_15 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_16 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_17 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_18 0.90 0.90 0.90 0.10 0.90 0.90 0.90
#> sample_19 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_20 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_21 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_22 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_23 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_24 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_25 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_26 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_27 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_34 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_35 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_36 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_37 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_38 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_28 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_29 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_30 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_31 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_32 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_33 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_16 sample_17 sample_18 sample_19 sample_20 sample_21 sample_22
#> sample_39 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_40 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_42 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_47 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_48 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_49 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_41 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_43 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_44 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_45 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_46 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_70 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_71 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_72 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_68 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_69 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_67 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_55 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_56 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_59 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_52 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_53 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_51 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_50 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_54 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_57 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_58 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_60 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_61 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_65 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_66 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_63 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_64 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_62 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_1 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_2 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_3 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_4 0.06 0.06 0.16 0.06 0.06 0.06 0.94
#> sample_5 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_6 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_7 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_8 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_9 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_10 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_11 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_12 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_13 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_14 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_15 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_16 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_17 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_18 0.90 0.90 1.00 0.90 0.90 0.90 0.10
#> sample_19 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_20 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_21 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_22 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_23 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_24 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_25 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_26 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_27 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_34 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_35 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_36 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_37 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_38 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_28 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_29 1.00 1.00 0.90 1.00 1.00 1.00 0.00
#> sample_30 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_31 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_32 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_33 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 0.00 1.00
#> sample_23 sample_24 sample_25 sample_26 sample_27 sample_34 sample_35
#> sample_39 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_40 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_42 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_47 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_48 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_49 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_41 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_43 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_44 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_45 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_46 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_70 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_71 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_72 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_68 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_69 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_67 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_55 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_56 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_59 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_52 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_53 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_51 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_50 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_54 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_57 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_58 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_60 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_61 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_65 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_66 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_63 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_64 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_62 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_1 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_2 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_3 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_4 0.94 0.06 0.94 0.06 0.94 0.94 0.94
#> sample_5 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_6 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_7 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_8 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_9 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_10 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_11 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_12 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_13 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_14 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_15 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_16 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_17 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_18 0.10 0.90 0.10 0.90 0.10 0.10 0.10
#> sample_19 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_20 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_21 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_22 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_23 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_24 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_25 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_26 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_27 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_34 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_35 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_36 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_37 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_38 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_28 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_29 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00
#> sample_30 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_31 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_32 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_33 1.00 0.00 1.00 0.00 1.00 1.00 1.00
#> sample_36 sample_37 sample_38 sample_28 sample_29 sample_30 sample_31
#> sample_39 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_40 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_42 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_47 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_48 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_49 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_41 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_43 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_44 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_45 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_46 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_70 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_71 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_72 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_68 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_69 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_67 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_55 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_56 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_59 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_52 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_53 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_51 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_50 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_54 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_57 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_58 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_60 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_61 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_65 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_66 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_63 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_64 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_62 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_1 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_2 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_3 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_4 0.94 0.94 0.94 0.94 0.06 0.94 0.94
#> sample_5 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_6 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_7 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_8 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_9 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_10 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_11 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_12 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_13 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_14 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_15 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_16 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_17 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_18 0.10 0.10 0.10 0.10 0.90 0.10 0.10
#> sample_19 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_20 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_21 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_22 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_23 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_24 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_25 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_26 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_27 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_34 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_35 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_36 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_37 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_38 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_28 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_29 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00
#> sample_30 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_31 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_32 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_33 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 1.00
#> sample_32 sample_33
#> sample_39 1.00 1.00
#> sample_40 1.00 1.00
#> sample_42 0.00 0.00
#> sample_47 0.00 0.00
#> sample_48 0.00 0.00
#> sample_49 1.00 1.00
#> sample_41 0.00 0.00
#> sample_43 0.00 0.00
#> sample_44 0.00 0.00
#> sample_45 0.00 0.00
#> sample_46 0.00 0.00
#> sample_70 0.00 0.00
#> sample_71 0.00 0.00
#> sample_72 0.00 0.00
#> sample_68 0.00 0.00
#> sample_69 0.00 0.00
#> sample_67 0.00 0.00
#> sample_55 1.00 1.00
#> sample_56 1.00 1.00
#> sample_59 0.00 0.00
#> sample_52 1.00 1.00
#> sample_53 1.00 1.00
#> sample_51 1.00 1.00
#> sample_50 1.00 1.00
#> sample_54 0.00 0.00
#> sample_57 1.00 1.00
#> sample_58 1.00 1.00
#> sample_60 0.00 0.00
#> sample_61 1.00 1.00
#> sample_65 1.00 1.00
#> sample_66 0.00 0.00
#> sample_63 1.00 1.00
#> sample_64 1.00 1.00
#> sample_62 1.00 1.00
#> sample_1 1.00 1.00
#> sample_2 0.00 0.00
#> sample_3 1.00 1.00
#> sample_4 0.94 0.94
#> sample_5 0.00 0.00
#> sample_6 1.00 1.00
#> sample_7 1.00 1.00
#> sample_8 1.00 1.00
#> sample_9 0.00 0.00
#> sample_10 0.00 0.00
#> sample_11 0.00 0.00
#> sample_12 1.00 1.00
#> sample_13 0.00 0.00
#> sample_14 0.00 0.00
#> sample_15 0.00 0.00
#> sample_16 0.00 0.00
#> sample_17 0.00 0.00
#> sample_18 0.10 0.10
#> sample_19 0.00 0.00
#> sample_20 0.00 0.00
#> sample_21 0.00 0.00
#> sample_22 1.00 1.00
#> sample_23 1.00 1.00
#> sample_24 0.00 0.00
#> sample_25 1.00 1.00
#> sample_26 0.00 0.00
#> sample_27 1.00 1.00
#> sample_34 1.00 1.00
#> sample_35 1.00 1.00
#> sample_36 1.00 1.00
#> sample_37 1.00 1.00
#> sample_38 1.00 1.00
#> sample_28 1.00 1.00
#> sample_29 0.00 0.00
#> sample_30 1.00 1.00
#> sample_31 1.00 1.00
#> sample_32 1.00 1.00
#> sample_33 1.00 1.00