get_param-ConsensusPartition-method.RdGet parameters
# S4 method for ConsensusPartition
get_param(object, k = object@k, unique = TRUE)A ConsensusPartition-class object.
Number of subgroups.
Whether to apply unique to rows of the returned data frame.
It is mainly used internally.
A data frame of parameters corresponding to the current k. In the data frame, each row corresponds to a partition run.
data(golub_cola)
obj = golub_cola["ATC", "skmeans"]
get_param(obj)
#> top_n k n_row n_col
#> 1 412 2 330 72
#> 2 412 3 330 72
#> 3 412 4 330 72
#> 4 412 5 330 72
#> 5 412 6 330 72
get_param(obj, k = 2)
#> top_n k n_row n_col
#> 1 412 2 330 72
get_param(obj, unique = FALSE)
#> top_n k n_row n_col
#> 1 412 2 330 72
#> 2 412 2 330 72
#> 3 412 2 330 72
#> 4 412 2 330 72
#> 5 412 2 330 72
#> 6 412 2 330 72
#> 7 412 2 330 72
#> 8 412 2 330 72
#> 9 412 2 330 72
#> 10 412 2 330 72
#> 11 412 2 330 72
#> 12 412 2 330 72
#> 13 412 2 330 72
#> 14 412 2 330 72
#> 15 412 2 330 72
#> 16 412 2 330 72
#> 17 412 2 330 72
#> 18 412 2 330 72
#> 19 412 2 330 72
#> 20 412 2 330 72
#> 21 412 2 330 72
#> 22 412 2 330 72
#> 23 412 2 330 72
#> 24 412 2 330 72
#> 25 412 2 330 72
#> 26 412 2 330 72
#> 27 412 2 330 72
#> 28 412 2 330 72
#> 29 412 2 330 72
#> 30 412 2 330 72
#> 31 412 2 330 72
#> 32 412 2 330 72
#> 33 412 2 330 72
#> 34 412 2 330 72
#> 35 412 2 330 72
#> 36 412 2 330 72
#> 37 412 2 330 72
#> 38 412 2 330 72
#> 39 412 2 330 72
#> 40 412 2 330 72
#> 41 412 2 330 72
#> 42 412 2 330 72
#> 43 412 2 330 72
#> 44 412 2 330 72
#> 45 412 2 330 72
#> 46 412 2 330 72
#> 47 412 2 330 72
#> 48 412 2 330 72
#> 49 412 2 330 72
#> 50 412 2 330 72
#> 51 412 3 330 72
#> 52 412 3 330 72
#> 53 412 3 330 72
#> 54 412 3 330 72
#> 55 412 3 330 72
#> 56 412 3 330 72
#> 57 412 3 330 72
#> 58 412 3 330 72
#> 59 412 3 330 72
#> 60 412 3 330 72
#> 61 412 3 330 72
#> 62 412 3 330 72
#> 63 412 3 330 72
#> 64 412 3 330 72
#> 65 412 3 330 72
#> 66 412 3 330 72
#> 67 412 3 330 72
#> 68 412 3 330 72
#> 69 412 3 330 72
#> 70 412 3 330 72
#> 71 412 3 330 72
#> 72 412 3 330 72
#> 73 412 3 330 72
#> 74 412 3 330 72
#> 75 412 3 330 72
#> 76 412 3 330 72
#> 77 412 3 330 72
#> 78 412 3 330 72
#> 79 412 3 330 72
#> 80 412 3 330 72
#> 81 412 3 330 72
#> 82 412 3 330 72
#> 83 412 3 330 72
#> 84 412 3 330 72
#> 85 412 3 330 72
#> 86 412 3 330 72
#> 87 412 3 330 72
#> 88 412 3 330 72
#> 89 412 3 330 72
#> 90 412 3 330 72
#> 91 412 3 330 72
#> 92 412 3 330 72
#> 93 412 3 330 72
#> 94 412 3 330 72
#> 95 412 3 330 72
#> 96 412 3 330 72
#> 97 412 3 330 72
#> 98 412 3 330 72
#> 99 412 3 330 72
#> 100 412 3 330 72
#> 101 412 4 330 72
#> 102 412 4 330 72
#> 103 412 4 330 72
#> 104 412 4 330 72
#> 105 412 4 330 72
#> 106 412 4 330 72
#> 107 412 4 330 72
#> 108 412 4 330 72
#> 109 412 4 330 72
#> 110 412 4 330 72
#> 111 412 4 330 72
#> 112 412 4 330 72
#> 113 412 4 330 72
#> 114 412 4 330 72
#> 115 412 4 330 72
#> 116 412 4 330 72
#> 117 412 4 330 72
#> 118 412 4 330 72
#> 119 412 4 330 72
#> 120 412 4 330 72
#> 121 412 4 330 72
#> 122 412 4 330 72
#> 123 412 4 330 72
#> 124 412 4 330 72
#> 125 412 4 330 72
#> 126 412 4 330 72
#> 127 412 4 330 72
#> 128 412 4 330 72
#> 129 412 4 330 72
#> 130 412 4 330 72
#> 131 412 4 330 72
#> 132 412 4 330 72
#> 133 412 4 330 72
#> 134 412 4 330 72
#> 135 412 4 330 72
#> 136 412 4 330 72
#> 137 412 4 330 72
#> 138 412 4 330 72
#> 139 412 4 330 72
#> 140 412 4 330 72
#> 141 412 4 330 72
#> 142 412 4 330 72
#> 143 412 4 330 72
#> 144 412 4 330 72
#> 145 412 4 330 72
#> 146 412 4 330 72
#> 147 412 4 330 72
#> 148 412 4 330 72
#> 149 412 4 330 72
#> 150 412 4 330 72
#> 151 412 5 330 72
#> 152 412 5 330 72
#> 153 412 5 330 72
#> 154 412 5 330 72
#> 155 412 5 330 72
#> 156 412 5 330 72
#> 157 412 5 330 72
#> 158 412 5 330 72
#> 159 412 5 330 72
#> 160 412 5 330 72
#> 161 412 5 330 72
#> 162 412 5 330 72
#> 163 412 5 330 72
#> 164 412 5 330 72
#> 165 412 5 330 72
#> 166 412 5 330 72
#> 167 412 5 330 72
#> 168 412 5 330 72
#> 169 412 5 330 72
#> 170 412 5 330 72
#> 171 412 5 330 72
#> 172 412 5 330 72
#> 173 412 5 330 72
#> 174 412 5 330 72
#> 175 412 5 330 72
#> 176 412 5 330 72
#> 177 412 5 330 72
#> 178 412 5 330 72
#> 179 412 5 330 72
#> 180 412 5 330 72
#> 181 412 5 330 72
#> 182 412 5 330 72
#> 183 412 5 330 72
#> 184 412 5 330 72
#> 185 412 5 330 72
#> 186 412 5 330 72
#> 187 412 5 330 72
#> 188 412 5 330 72
#> 189 412 5 330 72
#> 190 412 5 330 72
#> 191 412 5 330 72
#> 192 412 5 330 72
#> 193 412 5 330 72
#> 194 412 5 330 72
#> 195 412 5 330 72
#> 196 412 5 330 72
#> 197 412 5 330 72
#> 198 412 5 330 72
#> 199 412 5 330 72
#> 200 412 5 330 72
#> 201 412 6 330 72
#> 202 412 6 330 72
#> 203 412 6 330 72
#> 204 412 6 330 72
#> 205 412 6 330 72
#> 206 412 6 330 72
#> 207 412 6 330 72
#> 208 412 6 330 72
#> 209 412 6 330 72
#> 210 412 6 330 72
#> 211 412 6 330 72
#> 212 412 6 330 72
#> 213 412 6 330 72
#> 214 412 6 330 72
#> 215 412 6 330 72
#> 216 412 6 330 72
#> 217 412 6 330 72
#> 218 412 6 330 72
#> 219 412 6 330 72
#> 220 412 6 330 72
#> 221 412 6 330 72
#> 222 412 6 330 72
#> 223 412 6 330 72
#> 224 412 6 330 72
#> 225 412 6 330 72
#> 226 412 6 330 72
#> 227 412 6 330 72
#> 228 412 6 330 72
#> 229 412 6 330 72
#> 230 412 6 330 72
#> 231 412 6 330 72
#> 232 412 6 330 72
#> 233 412 6 330 72
#> 234 412 6 330 72
#> 235 412 6 330 72
#> 236 412 6 330 72
#> 237 412 6 330 72
#> 238 412 6 330 72
#> 239 412 6 330 72
#> 240 412 6 330 72
#> 241 412 6 330 72
#> 242 412 6 330 72
#> 243 412 6 330 72
#> 244 412 6 330 72
#> 245 412 6 330 72
#> 246 412 6 330 72
#> 247 412 6 330 72
#> 248 412 6 330 72
#> 249 412 6 330 72
#> 250 412 6 330 72