Skip to contents

Generate random GO IDs

Usage

random_GO(n, ont = c("BP", "CC", "MF"), db = "org.Hs.eg.db")

Arguments

n

Number of GO IDs.

ont

GO ontology. Value should be one of "BP", "CC" or "MF".

db

Annotation database. It should be from https://bioconductor.org/packages/3.10/BiocViews.html#___OrgDb.

Value

A vector of GO IDs.

Examples

# \donttest{
random_GO(100)
#>   [1] "GO:1901394" "GO:0018282" "GO:0070676" "GO:0021702" "GO:1905397"
#>   [6] "GO:0060061" "GO:0099068" "GO:0072289" "GO:0018211" "GO:0050765"
#>  [11] "GO:0042758" "GO:2001236" "GO:1990927" "GO:1903609" "GO:0051541"
#>  [16] "GO:0043416" "GO:0062234" "GO:0050999" "GO:0014870" "GO:2000107"
#>  [21] "GO:0044782" "GO:1990953" "GO:0061567" "GO:0045794" "GO:1905051"
#>  [26] "GO:0038171" "GO:0009165" "GO:1904542" "GO:1902573" "GO:1901301"
#>  [31] "GO:0032201" "GO:1905221" "GO:0048736" "GO:0021891" "GO:0021998"
#>  [36] "GO:0031102" "GO:0060462" "GO:0043149" "GO:0002419" "GO:0045136"
#>  [41] "GO:0099170" "GO:0016024" "GO:0010816" "GO:1901964" "GO:0072070"
#>  [46] "GO:0006555" "GO:1903351" "GO:0060516" "GO:1990172" "GO:0034370"
#>  [51] "GO:1904381" "GO:0098884" "GO:2001046" "GO:0050691" "GO:1904684"
#>  [56] "GO:0002431" "GO:0033693" "GO:0046888" "GO:0003171" "GO:0022412"
#>  [61] "GO:0006684" "GO:1903348" "GO:0060957" "GO:0042635" "GO:0009948"
#>  [66] "GO:0034111" "GO:0070918" "GO:0045647" "GO:0051639" "GO:1905806"
#>  [71] "GO:0000054" "GO:0060828" "GO:0044241" "GO:1900029" "GO:0051712"
#>  [76] "GO:0043380" "GO:0051124" "GO:0044663" "GO:0032834" "GO:0097213"
#>  [81] "GO:0010920" "GO:0072702" "GO:0046512" "GO:0001886" "GO:0018026"
#>  [86] "GO:1904850" "GO:0034219" "GO:0045292" "GO:0046825" "GO:0042573"
#>  [91] "GO:0061086" "GO:0036151" "GO:0021707" "GO:0045109" "GO:0035570"
#>  [96] "GO:0002504" "GO:0018105" "GO:1904651" "GO:0032497" "GO:0071941"
# }